Et nyt AI-værktøj udviklet af DTU Fødevareinstituttet med navnet PathogenFinder2 skal bruges til potentielt at forebygge pandemier.
Det skriver DTU Fødevareinstituttet i en pressemeddelelse.
Hensigten med værktøjet er, at det skal vurdere, hvorvidt en ukendt bakterie indeholder genetiske træk, der kan gøre den sygdomsfremkaldende.
Via prøver fra spildevand, raske mennesker og dyr kan værktøjet identificere bakterier, der er potentielt sygdomsfremkaldende, før de har inficeret nogen.
- Det er afgørende ikke blot at kunne forudsige bakterielle trusler, der ligner dem, vi allerede kender, men også at være forberedt på fremkomsten af en helt ny og hidtil ukendt sygdomsfremkaldende bakterie, siger forsker Alfred Ferrer Florensa.
Værktøjet fungerer lidt på samme måde som AI-sprogmodel for tekst. Ligesom den lærer mønstre i det menneskelige sprog, så lærer PathogenFinder2 proteinerne i bakteriernes "sprog" eller kendetegn.
- Den (PathogenFinder2, red.) klarer sig markant bedre end alle tidligere modeller, især når den støder på bakteriearter, vi aldrig har set før. Derudover giver den forklaringer på sine forudsigelser, fortæller Alfred Ferrer Florensa.
Værktøjet er trænet på mere end 21.000 bakteriegenomer - den samlede arvemasse i en bakterie også kaldet DNA - fra internationale databaser.
Det er det, der har givet det et unikt udgangspunkt for at kunne skelne mellem skadelige og harmløse bakterier. Også når den stødte på hidtil ukendte bakteriearter.
I undersøgelsen af proteinerne i bakterierne kan værktøjet også bruges af forskerne til at undersøge, hvilke af proteinerne der har størst indflydelse på bakteriernes potentiale til at udvikle sygdom.
Forskerne bag værktøjet understreger, at selv om det kan påpege interessante mønstre og potentielle risici, så skal resultaterne altid undersøges yderligere, før man kan drage endelige konklusioner.
/ritzau/