Jørgen Mads Clausen er formand for bestyrelsen, men har overladt direktørposten til Niels Bjørn Hansen, som er det fjerde ikke-familiemedlem, der leder virksomheden. Danfoss er styret gennem familiefonden Bitten og Mads Clausens Fond, og af grundlæggerens fem børn er de fire aktivt involveret i virksomheden.

Jørgens Mads Clausens to sønner, Mads og Marcus, har begge studeret på DTU for at forberede sig på en position i Danfoss. Mads er færdiguddannet som civilingeniør. Sønnerne står til at skulle dele en arv på godt 3,5 mia. kr.

Danfoss-familien har tætte forbindelser til kongehuset, og den ridderkorsdekorerede Jørgen Mads Clausen var da også sammen med sin mor, Bitten Clausen, og sin kone, Anette (foto), blandt bryllupsgæsterne ved Joachims og Maries bryllup.

Sammen med bl.a. familien Wedell og Annette Følsgaard fra Mærsk-familien har Jørgen Mads Clausen desuden ejendomsfirmaet Victoria Properties A/S, der blev etableret i 2006.